Το Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών λειτουργεί αυτοδύναμα δύο προγράμματα μεταπτυχιακών σπουδών ενώ συμμετέχει στη λειτουργία δύο άλλων διατμηματικών προγραμμάτων μεταπτυχιακών σπουδών.
Αυτοδύναμα στο Τμήμα λειτουργούν:
- Από το ακαδημαϊκό έτος 1995 – ’96 πρόγραμμα μεταπτυχιακών σπουδών που οδηγεί στη λήψη διδακτορικού διπλώματος.
- Από το ακαδημαϊκό έτος 1998 – ’99 δύο προγράμματα Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών Ειδίκευσης που οδηγούν στην απόκτηση διπλώματος ειδίκευσης με τίτλους:
- “Αειφόρος Σχεδιασμός Τεχνικών Έργων έναντι σεισμού και άλλων φυσικών κινδύνων” (Ιστοσελίδα) και
- “Προστασία περιβάλλοντος και βιώσιμη ανάπτυξη” (Ιστοσελίδα)
Τα δύο διατμηματικά προγράμματα μεταπτυχιακών σπουδών στα οποία συμμετέχει το Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών είναι τα:
- “Προστασία, συντήρηση και αποκατάσταση μνημείων πολιτισμού (Ιστοσελίδα)“
- “Οικολογική ποιότητα και διαχείριση υδάτων σε επίπεδο λεκάνης απορροής” (Ιστοσελίδα)
